targeted gene walking polymerase chain reaction

Шаговая полимеразная цепная реакция целевого гена — вариант обычной полимеразной цепной реакции (см.) для амплификации (см.) неизвестной последовательности ДНК, локализованной вверх или вниз (влево или вправо) от известной последовательности. Для этого первый последовательность-специфический ПЦР-праймер (целевой праймер, т.е. комплементарный экзону) и второй специфический праймер (внутренний праймер, гибридизующийся с той же нитью ДНК и расположенный близко к сайту целевого праймера) отжигаются (гибридизуются) к их целевым сайтам (мишеням) в геноме. Затем неспецифические, т.н. "шагающие" праймеры, комплементарные к последовательностям, расположенным выше или ниже мишени и сайта связывания внутреннего праймера, используются для амплификации расположенных между ними районов с помощью <I>Taq</I> ДНК-полимеразы (см. <I> полимераза Taq -полимераза </I>). Эту технику можно применять для изоляции последовательностей, прилежащих к уже известным районам без процедуры клонирования (см.) и выделения, а также для ДНК-фингерпринтинга (см.), обнаружения регуляторных районов и изолирования генов.